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新技术检测循环肿瘤DNA或更高效

发布时间:2017-07-03 点击量:

    美国纪念斯隆凯特琳癌症中心Pedram Razavi报告,自患者血样中发现的一种新的高强度基因测序法可高比例检测出循环肿瘤DNA。在这项入组124例乳腺癌肺癌前列腺癌患者的研究中,即便肿瘤中仅存在一个基因突变,新的高强度基因测序法的检出率仍达89%。总体而言,经组织样本证实,新测序法的基因突变检出率为73%。(2017年ASCO年会. 摘要号LBA11516)

    方法介绍

    研究中所采用的高强度基因测序法极具优势,兼顾了检测“宽度”和“深度”两方面的需求。该方法可大范围地检测基因组,包括508个基因和跨越200万个碱基对;精确度也非常高,基因组的每个区域都可被测序6万次,因此较常规测序技术可多出100倍的数据。这巨量的数据有助于开发血液检测仪早期发现癌症。目前的液态活检技术,包括商业化的检测,均是检测已确诊的癌症患者,其所提供的信息仅为庞大基因组信息中的一小部分,其目的是辅助监测疾病或发现活性突变以利于匹配可获得的药物或临床试验;但新的高强度基因测序法与上述技术截然不同。“新的高强度基因测序法是可行的,且可为临床决策提供无价的信息,而不需要任何的肿瘤组织样本。”Razavi表示,“该研究向通过血检早期发现癌症的目标迈出了重要的一步。”

    Razavi介绍,自血样中检测肿瘤DNA犹如大海捞针,因为每100个DNA片段中可能仅有1个片段是来自肿瘤细胞,其余的都来自正常细胞,且主要来自骨髓细胞。采用的联合分析技术在鉴别肿瘤DNA方面更敏感,深度测序技术使他们能发现罕见的肿瘤DNA片段。患者的肿瘤可能存在多种基因突变,既包括相同肿瘤不同部分中的不同突变,也包括肿瘤播散各位置中的不同突变。因此,基因组全范围测序对鉴别基因突变的数量和多样性而言都至关重要。

    研究详情

    研究者前瞻性地收集了161例转移性乳腺癌、NSCLC、激素抵抗性前列腺癌患者的血样和组织样本,但因37例的肿瘤样本或游离DNA基因分析结果不可用而被排除研究。结果显示,在89%的患者中,血样中至少能检测出肿瘤的1个基因突变;具体而言,在转移性乳腺癌患者中该检出率为97%,在NSCLC患者中的为85%,在转移性前列腺癌中的为84%。在三种肿瘤的组织样本中,研究者共发现了864个基因突变,其中627个(73%)也可自血样中检出。尤其重要的是,在未知肿瘤组织分析数据的情况下,血检76%的活性突变后来被组织检测结果所证实。

    研究评述

    “之前相关研究的主要着重点为,使用来自肿瘤组织的鉴别信息来查找肿瘤DNA;而本研究结果使我们在没有肿瘤组织信息的前提下高度自信地在全基因组范围内检测循环肿瘤DNA中的突变。”Razavi表示。

    ASCO专家John Heymach表示:“我们接连不断地见到充满希望的报告提示使用循环肿瘤DNA。在该技术被证实可用于癌症的早期发现之前,这种方法不失为一条可行之路。”

    (编译 张海峰)

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